Il polittico così ricomposto sembra il risultato della fusione di due distinti complessi, uno comprendente la parte centrale e l'altro i laterali. Entrambi i polittici sarebbero provenienti da Monterubbiano e forse dalla stessa chiesa di S. Francesco: parziale conferma di ciò è anche la registrazione delle tavoe al loro ingresso a Brera con diversa numerazione inventariale, oltre che la presunta cronologia, che daterebbe la parte centrale intorno al 1475 e i pannelli laterali al 1480 circa. Nel 1912 le coppie dei pannelli laterali vennero tra loro separate e inserite nell'attuale cornice.